O corpo de pesquisadores de Farmanguinhos trabalha em busca de soluções para doenças de grande relevância para a população brasileira. Estas são as principais linhas de pesquisa da unidade.

Doenças negligenciadas

• Chagas
• Tripanossomíase
• Leishmaniose
• Malária
• Tuberculose
• Hanseníase

Doenças de Alto Custo

• Aids
• Câncer
• Diabetes

Doenças de alta incidência

• Problemas cardiovasculares
• Infecções respiratórias