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2010 – Certificação em Boas Práticas de Fabricação (BPF) do prédio de Penicilínicos;

2012 – Início das operações na Fábrica de Medicamentos em Moçambique;

2013 – O antimalárico Artesunato + Mefloquina (ASMQ) é incluído na lista de medicamentos essenciais da Organização Mundial da Saúde (OMS);

2014 – Unidade conquistou a categoria Ouro no Prêmio da Qualidade PQ Rio;

Registro de oito medicamentos;

Início da implementação do novo sistema operacional da unidade ERP / SAP;

2015 – Farmanguinhos foi a primeira instituição pública a conquistar a Certificação Ambiental Internacional, ISO 14001;

2017 – Readequação da planta fabril e liberação da linha do Tacrolimo;

2018 – O Instituto formaliza cinco novas Parcerias de Desenvolvimento Produtivo. A lista inclui produtos de primeira linha contra HIV/Aids, hepatite C e para evitar rejeição de órgãos transplantados.